《生物芯片分析》书评

《生物芯片分析（影印版）》，英文书名“Microarray Analysis”，[美] M. 谢纳(Schena) 著，科学出版社，2003年10月出版。

这是一本关于生物芯片的教材，作者是早期发明并建立起生物芯片这项技术体系的多位科学家之一。生物芯片，按照英文microarray直译过来，也称为微阵列，或基因微阵列，是将核酸片段按照设计的排布顺序固定在固体表面，并通过与样本中的互补DNA或RNA序列特异性结合，来检测和分析基因表达的一种高通量技术。在20年前，这项技术曾是生物学研究的前沿主流，到如今，虽然高通量测序已经渗透到生命科学各个分支方方面面，取代它成为新的主流，但芯片技术由于其成本等优势，仍然被许多领域所继续广泛采用。这本教材是一本大部头，介绍了与生物芯片相关的方方面面，程度广泛到，甚至从化学元素周期表、各类有机化学基团、生物分子、核酸分子结构开始谈起，包括用于芯片制造的固体表面的材料、核酸片段的合成、机械运动部件的制造、荧光信号的激发和检测、检测结果数据分析、实际研究应用案例，乃至各种潜在商业化方向等。作为教科书，它在诸如“固定在玻片上的核酸片段叫target，联接荧光基团的待测样本的核酸片段叫probe”这样的被人错误混用的重要概念，都会专门花篇幅加以澄清，并溯源历史进行解释。很有意思的是，这本书的第13章中专门有一节介绍“Next Generation Sequencing（NGS）”，要知道这个NGS技术真正开始商业化并被逐步广泛使用，大概是本书出版五六年之后了，而且也不是当年书中介绍的那家公司（TeleChem）的产品。书中还有很多数据（如尺寸、价格）、软件，甚至很多技术细节本身，可能都略显过时，但对于深入理解生物芯片这项技术，尤其是对想要充分挖掘利用二十多年来积累的海量的各种公开的生物芯片数据，并将它们整合起来进行分析，这本书还是值得从头到尾仔细研读一番的，同时它对于了解现代生物技术中更复杂的微流控技术应该也有所提示和帮助。